Leitung


Dr. rer. nat. Sven Nahnsen  

Kontakt:

Tel.: +49-7071-29-72163

E-mail: sven.nahnsen[at]uni-tuebingen.de

 

Sprechstunde: Montags, 14:00-17:00 Uhr

 

www.qbic.uni-tuebingen.de

Biographie:

  • 2012, Leiter des Quantitativen Biologie Zentrums, Tübingen
  • 2011, Senior Posdoc- Wissenschaftler, Zentrum für Bioinformatik, Tübingen
  • 2007-2010, Wissenschaftlicher Mitarbeiter/ Doktorand, Proteom-Zentrum/ Zentrum für Bioinformatik, Tübingen
    (2010 Doktor, der Bioinformatik)
  • 2006 Wissenschaftlicher Mitarbeiter/ Master Student, Zentrum für Neuropsychiatrische Forschung, Universität Cambridge, UK
  • 2003-2006, M.Sc. der Biotechnologie, Hochschule für Biotechnologie Straßburg, Frankreich
    (2006 Diplôme d'ingénieur, Biotechnologie)
  • 2001-2003, B.Sc. Studium der Biomathematik, Universität Greifswald, Germany
    (2003 Vordiplom, Biomathematik)

Publikationen:

 

  • Hendrik Weisser, Sven Nahnsen, Jonas Grossmann, Lars Nilse, Andreas Quandt, Hendrik Brauer, Marc Sturm, Erhan Kenar, Oliver Kohlbacher, Ruedi Aebersold, Lars Malmström
    An automated pipeline for high-throughput label-free quantitative proteomics.
    J Proteome Res. 2013 Feb 8.. [Epub ahead of print]. PMID:23391308.

  • Sven Nahnsen, Timo Sachsenberg, Oliver Kohlbacher
    PTMeta: Increasing identification rates of modified peptides using modification pre-scanning and meta-analysis
    Proteomics. 2013 Jan 20.. [Epub ahead of print]. PMID:23335442.

  • Sven Nahnsen, Chris Bielow, Knut Reinert, Oliver Kohlbacher
    Tools for label-free peptide quantification
    Mol Cell Proteomics. 2012 Dec 17. [Epub ahead of print]. PMID:23250051.

  • Sven Nahnsen, Oliver Kohlbacher
    In-silico design of targeted SRM-based experiments.
    BMC Bioinformatics. 2012;13 Suppl 16:S8. Epub 2012 Nov 5. PMID:23176520.

  • Sven Nahnsen, Andreas Bertsch, Jörg Rahnenführer, Alfred Nordheim, Oliver Kohlbacher
    Probabilistic consensus scoring improves tandem mass spectrometry peptide identification.
    J Proteome Res. 2011 Aug 5;10(8):3332-43. Epub 2011 Jun 23. PMID:21644507.

  • Emanuel Schwarz, Phil Whitfield, Sven Nahnsen, Lan Wang, Hillary Major, Markus Leweke, Dagmar Koethe, Pietro Lio, S. Bahn
    Alterations of primary fatty acid amides in serum of patients with severe mental illness.
    Front Biosci (Elite Ed). 2011 Jan 1;3:308-14. PMID: 21196311.

  • Karsten Krug, Sven Nahnsen and Boris Macek
    Mass spectrometry at the interface of proteomics and genomics 

    Mol Biosyst. 2011 Feb;7(2):284-91. Epub 2010 Oct 21. PMID:20967315.

  • Tobias Sinnberg,  Moritz Menzel, Susanne Kaesler, Tilo Biedermann, Birgit Sauer, Sven Nahnsen, Michael Schwarz, Claus Garbe, and Birgit Schittek
    Suppression of casein kinase 1-alpha in melanoma cells induced a switch in beta-catenin signaling to promote metastasis

    Cancer Research.  2010 Sep 1;70(17):6999-7009. Epub 2010 Aug 10. PMID:20699366.

  • Andreas Bertsch, Stephan  Jung, Alexandra Zerck, Nico Pfeifer, Sven Nahnsen, Carsten Henneges, Alfred Nordheim, and Oliver Kohlbacher
    Optimal de novo design of MRM experiments for rapid assay development in targeted proteomics.
    J Proteome Res. 2010 May 7;9(5):2696-704. PMID:20201589.

  • Sven Nahnsen, Alfred Nordheim and Oliver Kohlbacher
    A geometric matching approach improves throughput and accuracy in DIGE-based proteomics.Proceedings of the sixth International Workshop on Computational Systems Biology (WCSB 2009). WCSB 2009. Link.